В Иволгинском дацане находятся пять субурганов — ступ, своеобразных памятников важнейших священных событий буддистов. Считается, что их возводили ещё при жизни Будды 
Шакьямуни. Случалось, в них хоронили лам, в домашнем алтаре каждого верующего есть маленькая копия ступы. Также, на территории дацана, действует Буддийский университет Даши Чойнхорлин им. Дамба Даржа Заяева. Название с тибетского переводится как "земля счастливого учения". Институт и по сей день является единственным учебным учреждением подобного рода в РФ, его деятельность направлена на углублённое изучение и преподавание буддийской философии в соответствии с программами монастырских школ дореволюционной Бурятии.

Одна из наиболее почитаемых буддистами святынь на территории России — храм Чистой земли. В этом храме хранится драгоценное тело 12 Хамбо Ламы Итигэлова. Хамбо Лама Итигэлов умер в 1927, будучи в состоянии медитации. Своим ученикам он завещал, чтобы они пришли через 30 лет и посмотрели на его тело. В 1955 члены делегации во главе с Хамбо Ламой Бармаевым подняли тело, убедились в его сохранности и обратно возложили на то же место. В 2002, через 75 лет после захоронения, тело было перенесено в дацан. Когда тело ламы обследовали эксперты-патологоанатомы, их поразила фантастическая его сохранность - никаких следов тления, полная подвижность суставов, цвет кожи естественный, наощупь она мягкая, словно живая. Буддисты считают, что в теле Итигэлова проявляется дух Будды и что лама жив. Далай-лама 14 выразил мнение, что, возможно, Хамбо Лама погрузился в состояние глубокой медитации и тончайшая форма его сознания “намши” продолжает находиться в теле.

Тело Итигэлова хранится во дворце Хамбо ламы. К нему открывают доступ лишь 8 дней в году - на это время его переносят в Согчен Дуган. В Иволгинском дацане давно сложился определенный распорядок проведения богослужений - ежедневных служб и больших хуралов (например, каждый день, когда разрешено посещение тела Итигэлова, сопровождается хуралом). Каждый год здесь проводятся большие осенний и зимний хуралы, летом - праздник Майдари в честь бодисатвы Майтрейя - символа любви, надежды на будущее и сострадания. Считается, что Майтрей - преемник самого Будды. Праздничная церемония длится несколько дней и завершается  торжественным шествием верующих вокруг храма. Во главе процессии на колеснице едет лама, держа в руках статую Майдари.
Ежемесячно, в Майдарин дугане проводится трёхдневный духовный обряд (ретрит), принять участие в котором могут все желающие. В течение этого времени участники ретрита ночуют в домах лам, читают мантры, совершают поклоны. Перед тем, как приступить к выполнению практики, каждый даёт обет не убивать, не лгать, не есть, не пить спиртного, молчать. Цель ритуала — очиститься от зла и научиться сострадать всем видам живых существ, которых в буддизме шесть - жители ада, голодные духи, животные, люди, полубоги и боги.